“新系”因紀律嚴明，給人“槍口一致對外”的印象。但近幾年，民進黨從“執(zhí)政”、“在野”再度重返“執(zhí)政”，權力與利益變得錯綜復雜，“新系”也從“萬流歸宗”開始“分流”，內部分成“北流”跟“南流”兩股勢力。“北流”的代表如吳乃仁、林濁水、段宜康，“南流”則是賴清德和陳菊等人。
近年來，“南流”逐漸壯大，賴清德和陳菊的勢力已經不在“新系”的掌控之下，因此也加深了兩個流派之間的斗爭。尤其“九合一”選舉失敗后，“北流”再度希望賴、菊趕快“下船”，但一個繼續(xù)留守，一個辭職遙遙無期，讓“北流”很無奈。更生氣的是，原本屬于“北流”的鄭文燦，如今卻“背叛了和段宜康30年的兄弟情誼”，力拱罵過段宜康的卓榮泰參選黨主席，這當然讓鄭文燦的“干爹”吳乃仁忍無可忍，決定最后捅一刀。
外界都知道，吳乃仁對鄭文燦有恩，但對于吳乃仁的怒火，鄭文燦15日上午僅簡單表示，不會對派系事務做評論，“現(xiàn)在生存發(fā)展、改革再造是民進黨重要的課題，其他的議題不重要。”鄭文燦之前還提到：“黨主席的辭職及改選，本來就是黨的事務，不是派系的事務，沒有哪個政黨打敗戰(zhàn)還會內戰(zhàn)，如果是這樣的政黨，那就沒救了。”
