缺標(biāo)準(zhǔn):數(shù)據(jù)質(zhì)量影響報(bào)告準(zhǔn)確性
中國食品藥品檢定研究院副院長王佑春研究員用“五多”表示下一代基因測序技術(shù)走向標(biāo)準(zhǔn)化應(yīng)用的難處。“與傳統(tǒng)診斷技術(shù)相比,下一代基因測序技術(shù)檢測靶點(diǎn)多、通量高、數(shù)據(jù)量多、分析流程多、質(zhì)量控制參數(shù)多。”這意味著用“整齊劃一”要求每一個(gè)檢測程序是艱難的。
王佑春簡要解釋了測序技術(shù)的內(nèi)容:“下一代基因測序的診斷由實(shí)驗(yàn)室操作和生物信息學(xué)分析組成,實(shí)驗(yàn)操作部分包括核酸提取、靶序列擴(kuò)增或捕獲,信息學(xué)分析包括讀取數(shù)據(jù)、過濾數(shù)據(jù)、拼接序列、比對(duì)解讀以及結(jié)果報(bào)告。”
由于測序的復(fù)雜性,對(duì)其質(zhì)量評(píng)價(jià)面臨著許多挑戰(zhàn)。此外,與傳統(tǒng)診斷技術(shù)相比,測序技術(shù)包括的生物信息學(xué)分析部分是此前所未有的,這要求建立新領(lǐng)域的標(biāo)準(zhǔn),例如建立數(shù)字參考品,包括標(biāo)準(zhǔn)序列或由其組成的標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)庫等。王佑春表示,“當(dāng)建立標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行引導(dǎo),企業(yè)才知道應(yīng)如何生產(chǎn)這樣的試劑,促進(jìn)產(chǎn)業(yè)走向規(guī)范化。”
由于標(biāo)準(zhǔn)的缺失,目前我國在基因檢測的數(shù)據(jù)質(zhì)量上令人擔(dān)憂。楚文江此前與國內(nèi)生物企業(yè)洽談合作后表示,在數(shù)據(jù)質(zhì)量控制方面國內(nèi)做的還遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠。如果數(shù)據(jù)錯(cuò)了,后期分析、結(jié)果都是在浪費(fèi)時(shí)間。
業(yè)界有人認(rèn)為,二代測序檢測容易分析難。楚文江表示,這在學(xué)術(shù)層面上是對(duì)的。但在應(yīng)用層面上,大家的分析方法基本相通,所用數(shù)據(jù)庫可以相互補(bǔ)充。在此基礎(chǔ)上,檢測數(shù)據(jù)質(zhì)量更加重要,它不僅是突破的差異點(diǎn),也直接影響著后期報(bào)告的準(zhǔn)確性。所謂“失之毫厘謬以千里”,其中的毫厘可能只是幾個(gè)堿基對(duì)的差異。
呼喚監(jiān)管:保障科學(xué)性項(xiàng)目最終勝出
“嚴(yán)格的監(jiān)管表面看起來似乎阻礙創(chuàng)新,但它可以保證真正具有科學(xué)性的項(xiàng)目最終勝出。”楚文江認(rèn)為,中國的監(jiān)管和行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)相對(duì)比較寬松,早期發(fā)展迅猛,但在一定的時(shí)期內(nèi)需要撥亂反正,要防止醫(yī)學(xué)創(chuàng)新被市場綁架。
據(jù)2015年底全國性的腫瘤二代測序?qū)嶒?yàn)室質(zhì)量評(píng)估報(bào)告結(jié)果顯示,其中55%的實(shí)驗(yàn)室是不合格的,甚至22%的實(shí)驗(yàn)室居然得到的是0分。而中國食品藥品檢定研究院最近做過的一項(xiàng)樣本封盲檢測顯示,國內(nèi)4家測序企業(yè)對(duì)于同樣的樣本給出的診斷結(jié)果并不一致。楚文江認(rèn)為,目前中國的基因檢測還沒有成熟完整的質(zhì)量監(jiān)管體系,體現(xiàn)在數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性上沒有保證。而美國則調(diào)動(dòng)聯(lián)邦政府層面比如美國食品藥品監(jiān)督管理局和美國聯(lián)邦醫(yī)療保險(xiǎn)和醫(yī)療救助服務(wù)中心,州政府層面比如各州公共衛(wèi)生部門,以及行業(yè)協(xié)會(huì)等進(jìn)行多重質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)和監(jiān)管。
與楚文江的觀點(diǎn)相似,中國食品藥品檢定研究院劉東來等此前撰文梳理了美國對(duì)實(shí)驗(yàn)室研發(fā)診斷試劑的監(jiān)管之路,文章指出,醫(yī)療機(jī)構(gòu)此前未能得到明確監(jiān)管,直接導(dǎo)致了基因檢測市場的種種亂象,既無法保障消費(fèi)者或患者的切身利益,又無法真正地促進(jìn)技術(shù)創(chuàng)新和行業(yè)發(fā)展。
監(jiān)管需要回答的問題包括:檢測者擁有什么的資質(zhì),采用什么樣的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn),是否定期進(jìn)行熟練測試等。楚文江認(rèn)為,這些都是患者關(guān)注的問題。
2015年7月,衛(wèi)健委發(fā)布《測序技術(shù)的個(gè)體化醫(yī)學(xué)檢測應(yīng)用技術(shù)指南(試行)》等指南,旨在進(jìn)一步規(guī)范對(duì)臨床實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行基因檢測的管理。隨著近年來,醫(yī)療機(jī)構(gòu)逐步可以委托獨(dú)立設(shè)置的醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室、病理診斷中心、醫(yī)學(xué)影像診斷中心等提供第三方服務(wù),此類舉措在提升服務(wù)同質(zhì)化的同時(shí)也進(jìn)一步考驗(yàn)了政府部門的監(jiān)管能力和智慧。
越來越多的獨(dú)立實(shí)驗(yàn)室和公司都在進(jìn)行相關(guān)技術(shù)的研發(fā),這就導(dǎo)致了監(jiān)管范圍需要擴(kuò)大。這也是美國此前面臨的問題。該如何應(yīng)對(duì)?對(duì)監(jiān)管者的考驗(yàn)仍在繼續(xù)。
